Japão, 1988. Uma explosão causada por um menino com poderes psíquicos rasga através da cidade de Tóquio e inflama o fusível que leva a 3ª Guerra Mundial. A fim de evitar mais destruição, ele é capturado e levado sob custódia, para nunca mais se ouvir falar dele. Agora, no ano de 2019, uma versão restaurada da cidade conhecida como Neo-Tóquio -uma área repleta de violência de gangues e terrorismo contra o governo atual- está em seu lugar. Aqui, Shoutarou Kaneda comanda "The Capsules", um grupo de desajustados conhecidos por montar grandes motocicletas personalizadas e estarem em constante conflito com os seus rivais "The Clowns". É durante uma dessas batalhas que o melhor amigo do Shoutarou, Tetsuo Shima é pego em um acidente com Akira -o mesmo rapaz que causou o desastre catastrófico, há muitos anos- que está em livre depois de escapar seu confinamento. Agora, como Tetsuo desenvolve suas próprias habilidades misteriosas, o governo pretende colocar ele em quarentena, bem como em uma tentativa desesperada para impedi-lo de libertar o poder destrutivo que poderia mais uma vez trazer a cidade de joelhos.
